1、这种缺陷，一般是因为选材切割珠子时，材料大小不足，或者在钻孔的时候，手法不是很娴熟，钻孔钻歪了，就会造成车珠有一切面无法切到，一般这种缺陷存在于珠子中间位置，看上去就好像一个球体被刀割掉了一块，颜色呈现比珠子颜色浅。
2、这种缺陷通常称崩口缺陷，位置在佛珠的珠孔处。造成这种缺陷的原因有很多，有可能是材料本身的质量问题，也有可能是人为因素，比如制作过程中没掌握好技巧等，像这些原因都是有可能导致崩口缺陷的。不过一般品质较高的珠子如果有这种缺陷，那么是材料本身的问题的可能性更大，品质差的珠子有可能是人为因素造成的！
3、像孔洞这种缺陷就是因为材料本身的问题造成的了。选材时没有细心挑选，选择了劣质沉香，或者材料的瑕疵隐藏选材时没有被发现，制成成品才显现等。如果是人工拉花据切材料的话，会尽量避免有缺陷的地方，要是用台锯就很难避免了。
4、开裂，一般品质较低的沉香珠子比较容易发生开裂，造成开裂的原因基本是手工抛光时用力太大造成的，表面会有一道道小缝，开裂的程度是不一样的，开裂严重的，肉眼可以看出来，有的只开裂一点点，这样肉眼看不到，只有在抛光机才会显现出来。
5、修补珠子，首先确定下珠子原材料，再用相同材料的小木屑削成形状大小和缺陷一样的小木块，然后用胶水粘上，缺陷填补好后，需要再用水磨机重新打磨圆整，最后手工抛光，如果缺陷较大，修整后会比较明显，小缺陷比较不容易看出来。
以上这些缺陷程度较小，不影响沉香珠子的佩戴，是不需要修补的，毕竟沉香是天然野生之物，本身就有不规则特性，且木质较软，完美的珠子还是很少的。
